વકફ સુધારા અધિનિયમ, ૨૦૨૫ ને પડકારતી અરજીઓ પર કેન્દ્રએ સુપ્રીમ કોર્ટમાં પોતાનો જવાબ દાખલ કર્યો, જેમાં કહેવામાં આવ્યું કે છેલ્લા ૧૦૦ વર્ષથી વકફને વપરાશકર્તા દ્વારા નોંધણી પછી જ માન્યતા આપવામાં આવે છે, મૌખિક રીતે નહીં. તેથી, સુધારો જરૂરી હતો. કેન્દ્ર સરકારે જણાવ્યું હતું કે વકફ કાઉન્સીલ અને વકફ બોર્ડના ૨૨ સભ્યોમાંથી વધુમાં વધુ બે બિન-મુસ્લીમ હશે, જે એક એવું પગલું છે જે સમાવિષ્ટતાનું પ્રતિનિધિત્વ કરે છે અને વકફના વહીવટમાં દખલ કરતું નથી. કેન્દ્રએ જણાવ્યું હતું કે વકફ મિલકતો તરીકે ઇરાદાપૂર્વક અથવા ખોટી રીતે ઉલ્લેખિત સરકારી જમીનની ઓળખ મહેસૂલ રેકોર્ડમાં સુધારો કરવા માટે છે અને સરકારી જમીનને કોઈપણ ધાર્મિક સમુદાયની જમીન તરીકે ગણી શકાય નહીં.

કેન્દ્ર સરકારે સુપ્રીમ કોર્ટમાં દાખલ કરેલા પોતાના જવાબ દ્વારા કાયદાને પડકારતી અરજીઓને ફગાવી દેવાની માંગ કરી છે. કેન્દ્ર સરકારે પોતાના જવાબમાં કહ્યું છે કે સુપ્રીમ કોર્ટ કોઈપણ કાયદાની જોગવાઈ પર આંશિક વચગાળાનો સ્ટે લાદી શકે નહીં. ન્યાયિક સમીક્ષા દ્વારા સમગ્ર કાયદાને રોકવો પડશે. આ ઉપરાંત, એવું પણ માનવામાં આવે છે કે સંયુક્ત સંસદીય સમિતિના સૂચનો પર સંસદ દ્વારા બનાવવામાં આવેલ કાયદો કાળજીપૂર્વક વિચારણા પછી બનાવવામાં આવ્યો હોવો જોઈએ. વકફ મુસ્લીમોની ધાર્મિક સંસ્થા નથી પરંતુ એક વૈધાનિક સંસ્થા છે.

કેન્દ્ર સરકારે સુપ્રીમ કોર્ટને જણાવ્યું હતું કે વકફ સુધારા કાયદા મુજબ, મુતવલ્લીનું કાર્ય ધર્મનિરપેક્ષ છે, ધાર્મિક નથી. આ કાયદો ચૂંટાયેલા જનપ્રતિનિધિઓની લાગણીઓને પ્રતિબિંબિત કરે છે. તેમણે જ બહુમતીથી તેને પસાર કરાવ્યું. આ બિલ પસાર થતાં પહેલાં, સંયુક્ત સંસદીય સમિતિની ૩૬ બેઠકો યોજાઈ હતી અને ૯૭ લાખથી વધુ હિતધારકોએ સૂચનો અને મેમોરેન્ડમ આપ્યા હતા. સમિતિએ દેશના દસ મોટા શહેરોની મુલાકાત લીધી અને લોકો વચ્ચે જઈને તેમના મંતવ્યો જાણ્યા.